Description
Job Informationen ######
Arbeitsort: Bern Pensum: 80-100% Deine Aufgaben: Du entwickelst, validierst und betreust klinische NGS-Workflows für Panels, WES und WGS. Dazu gehören Varianten-Calling, Annotation, Qualitätskontrolle und Datenübertragung. Du automatisierst reproduzierbare Bioinformatik-Workflows, pflegst Datenbanken und Monitoring-Werkzeuge, entwickelst Anwendungen für den Zugriff auf Sequenzierdaten und integrierst Labor-Workflows in sLIMS. Dein Profil: Du verfügst über einen Masterabschluss in Bioinformatik, Computational Biology, Informatik oder eine vergleichbare praktische Qualifikation. Gute Kenntnisse in Python, Linux und Shell-Scripting sowie ein Grundverständnis der Hochdurchsatzsequenzierung werden vorausgesetzt. Erfahrung mit SQL, Nextflow, Snakemake, HPC, Java oder Groovy sowie Docker oder Singularity ist von Vorteil. Gute Deutsch- und Englischkenntnisse, eine strukturierte Arbeitsweise und Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit runden dein Profil ab. Geboten werden eine sinnstiftende Tätigkeit in der Präzisionsmedizin, moderne Technologien, eine strukturierte Einarbeitung sowie fachliche und persönliche Entwicklungsmöglichkeiten.
Benötigte Skills ######
- Deutsch
- Englisch
- Linux
- Python
- Groovy
- JAVA
- SQL
- Bioinformatik